L’idea di creare un Museo del Mare a Siracusa, che raccogliesse la storia e le tradizioni dei costruttori navali e dei pescatori locali, nacque grazie all’impegno di Sebastiano ed Augusto Aliffi. Negli anni ’90, con l’aiuto dei cugini Daniele ed Alberto e di molti appassionati, iniziarono la raccolta e la selezione di attrezzi e reperti del cantiere navale, che era stato quasi completamente smantellato alla fine degli anni ’80 a causa dei costi insostenibili.

Nasce l’associazione Syrakosia, che unisce diverse realtà siracusane impegnate nella divulgazione culturale e nella salvaguardia delle tradizioni. Nel 2002 viene pubblicato il libro “Il Buzzettu Sarausanu”, che descrive la storia dell’imbarcazione siracusana “buzzettu” e la filosofia progettuale dei calafatari. Nel 2003 si tiene il convegno “Musei del mare e cultura del mare”, con la partecipazione di esperti da diverse città. Nel 2004 viene dichiarata di eccezionale interesse etno-antropologico la collezione degli attrezzi dei calafatari. Nel 2005 viene pubblicato il libro “Musei del mare e cultura del mare”. Nel 2007 si tiene una mostra sulle tradizioni di pesca e nel 2010 viene inaugurato il primo Museo del mare di Siracusa. Nel 2012 viene pubblicato il libro “Storia della Marineria Siracusana“, scritto da Augusto con l’aiuto del capitano Giuseppe Gaetano Rodante. 

Nel 2013 nasce l’associazione onlus SIRMUMA. Nel 2014 si svolge l’evento “Mare al museo“, con attività legate al mare a Ortigia e al Museo del Mare. Viene anche organizzata la mostra “Le Signore dello Ionio” e realizzato un CD documentario. Nel 2015 viene pubblicato un decreto di salvaguardia della collezione di reperti dei naviganti. Nel 2016 si tiene la mostra dei modellini di Alberto Aliffi a Marzamemi. Nel 2017 viene pubblicato il libro “I graffiti” di Augusto Aliffi. Nel 2018 si organizza la “Giornata del mare e della cultura marinara”. Dal 2019 al 2022 il museo viene gestito in via Zummo e si collabora con gli istituti scolastici. Nel 2023 i reperti vengono trasferiti alla marina e allestita la mostra “Verso il Museo del Mare di Siracusa”.